Os anticorpos IgG4 estão associados a reações não-atópicas ou "tardias" que podem complicar ou contribuir para vários problemas de saúde e são considerados como a forma mais comum de intolerância imunológica imediata.
Essas reações são mais complicadas de serem identificadas, pois podem ocorrer horas ou até mesmo dias após o consumo do alimento agressor. Em alguns casos, pode-se ingerir um alimento por vários dias antes de desenvolver o processo reativo e seus sintomas.
As alergias alimentares "transparentes" são causadas por níveis aumentados de anticorpos IgG4 em reação a alimentos específicos, e geralmente são difíceis de se evitar por serem comuns como o leite, o milho e o trigo.
Níveis altos simultâneos das de anticorpos IgG alimento-específico estão relacionados à hiperpermeabilidade intestinal. Com uma única amostra é possível determinar as reações para 30 ou 90 alimentos diferentes.